Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRNQ16849 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPRNQ16849 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRNQ16849 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRNQ16849 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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