Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2B3Q16720 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2B3Q16720 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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