Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HIST3H3Q16695 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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