Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCAQ16586 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms