Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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