Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms