Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CST6Q15828 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CST6Q15828 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CST6Q15828 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms