Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC1A5Q15758 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC1A5Q15758 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms