Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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