Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIX1Q15475 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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