Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRRQ15256 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRRQ15256 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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