Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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BRD3Q15059 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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