Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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