Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms