Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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