Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
EXOSC2Q13868 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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