Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms