Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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