Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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CUL4AQ13619 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4AQ13619 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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