Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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