Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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PRDM2Q13029 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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