Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSPB3Q12988 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms