Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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TWF1Q12792 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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TWF1Q12792 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TWF1Q12792 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TWF1Q12792 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TWF1Q12792 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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