Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXO1Q12778 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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