Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms