Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms