Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN7AQ01118 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms