Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms