Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms