Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms