Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL23P55773 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL23P55773 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL23P55773 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL23P55773 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL23P55773 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL23P55773 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL23P55773 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms