Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF135P52742 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms