Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A3P43003 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms