Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms