Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms