Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms