Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLD1P28340 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLD1P28340 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLD1P28340 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms