Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP4AP20648 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms