Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms