Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DESP17661 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DESP17661 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DESP17661 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DESP17661 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DESP17661 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DESP17661 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DESP17661 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms