Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT10P13645 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT10P13645 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms