Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms