Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms