Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms