Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEFLP07196 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEFLP07196 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEFLP07196 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEFLP07196 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEFLP07196 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEFLP07196 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEFLP07196 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEFLP07196 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms