Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSF2P04141 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSF2P04141 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms