Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOL3O95236 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL3O95236 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms