Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN7O94888 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms