Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F6O75461 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F6O75461 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F6O75461 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms