Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPLO60437 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms